Jana se ve svém výzkumu zaměřuje na problematiku nerovností ve vzdělávání. Ve své dizertační práci nazvané "Spolu, a přece odděleně: podoba diferencované výuky na druhém stupni základních škol" se věnuje jedné z méně viditelných forem kognitivní diferenciace žáků uvnitř základních škol.
V rámci vícepřípadové replikační studie například zjistila, že učitelé investují didaktické úsilí především do výuky ve výkonových skupinách, zatímco společná výuka zůstává na úrovni frontálního vyučování. Žáci mají málo povzbudivé zkušenosti se společnou výukou, což je vede k touze po totální diferenciaci, která však odporuje snahám o její utlumení a posunu směrem k inkluzivitě. Celá práce je k dizpozici v IS MU.